Bioaraba y la OSI Araba participan en la detección de una nueva forma recombinante del Virus de la Inmunodeficiencia Humana tipo 1

El Virus de la Inmunodeficiencia Humana tipo 1 (VIH-1) se caracteriza por su alta tasa de mutación y recombinación, lo que conlleva una extraordinaria diversidad genética. Se han descrito 4 grupos del VIH-1: M, N, O y P, siendo el grupo M el causante de la pandemia global. Esta a su vez se subdivide en 10 subtipos (A-D, F-H, J-L). El subtipo C es el más prevalente en la pandemia, circulando principalmente en el sur y este de África, India y sur de Brasil, mientras que el subtipo B es el más prevalente en Europa occidental y en América.

La recombinación genética entre subtipos conlleva la generación de formas recombinantes únicas y circulantes (URFs y CRFs), que representan alrededor del 23% de las cepas del VIH-1 que circulan en el mundo. Para definir una forma recombinante circulante se han de caracterizar al menos tres genomas casi completos del virus de individuos no relacionados epidemiológicamente, que han de mostrar un patrón en mosaico idéntico y agrupar en árboles filogenéticos, aparte de las CRFs previamente descritas.

Hasta la fecha, se han descrito en la literatura 102 CRFs. En el estudio se describe la primera CRF_BC identificada en España y la segunda en Europa, a la que se le ha designado CRF108_BC y que deriva de los subtipos B y C.

Para la realización del estudio se analizaron muestras de sangre o plasma recogidas entre los años 1999 y 2020 de más de 1300 pacientes infectados por el VIH-1, procedentes de 10 comunidades autónomas distintas. Las secuencias de proteasa-retrotranscriptasa (PR-RT) obtenidas para el estudio de resistencias a antirretrovirales o estudios de epidemiología molecular, sirvieron para realizar análisis filogenéticos, filogeográficos y filodinámicos.

La nueva forma recombinante CRF108_BC se detectó en 15 individuos y su expansión ha tenido lugar entre los años 2006 a 2019, ya que un 53% de los casos se han diagnosticado en los últimos 4 años, concentrándose en el País Vasco (10 de los 15 casos en Vitoria-Gasteiz), y solo un caso detectado en Zaragoza.

Mediante estudios filogeográficos y filodinámicos se ha podido estimar que el origen más probable de la CRF108-BC se situó en Vitoria-Gasteiz, alrededor del año 2000, con una alta tasa de probabilidad de que su ancestro procediera de Brasil. Considerando que más de la mitad de estos casos se han diagnosticado en los últimos 4 años, es importante seguir realizando una vigilancia epidemiológica para evaluar si sigue habiendo propagación de esta nueva forma recombinante.

La vigilancia epidemiológica de las nuevas formas recombinantes del VIH-1 que se están expandiendo es necesaria para la toma de decisiones en cuestiones de salud pública como puede ser la selección de inmunógenos óptimos para el desarrollo de vacunas efectivas.

Se ha identificado una nueva CRF del VIH-1, designada CRF108_BC, derivada de los subtipos B y C mediante el análisis de 6 NFLG de 3 ciudades del norte de España, que en PR-RT formaban un clúster de 15 infecciones. Los análisis filogenéticos y filogeográficos apuntan a un origen en Vitoria-Gasteiz, hacia el año 2000, y a un ancestro brasileño del virus parental de subtipo C, aunque no está claro si la recombinación tuvo lugar en Brasil o en España.

Entre las CRFs derivadas de los subtipos B y C, CRF108_BC es la duodécima que se identifica, la primera en España y la segunda en Europa. Su propagación es limitada habiéndose detectado únicamente 15 casos, la mayoría de ellos transmitidos por vía heterosexual. Considerando que más de la mitad de estos casos se han diagnosticado en los últimos 4 años, es importante seguir realizando una vigilancia epidemiológica para evaluar si sigue habiendo propagación de esta nueva CRF.